Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PudpQ9D5U5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PudpQ9D5U5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms