Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syce1Q9D495 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms