Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Snx29Q9D3S3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snx29Q9D3S3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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