Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rnf128Q9D304 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rnf128Q9D304 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms