Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef12Q9D2F1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms