Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bcas2Q9D287 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bcas2Q9D287 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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