Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spns3Q9D232 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms