Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rpl34Q9D1R9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpl34Q9D1R9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms