Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Chordc1Q9D1P4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chordc1Q9D1P4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms