Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18l2Q9D174 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ss18l2Q9D174 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ss18l2Q9D174 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ss18l2Q9D174 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms