Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc3Q9D114 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms