Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpsap1Q9D0M1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms