Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rfc5Q9D0F6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rfc5Q9D0F6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms