Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc77Q9CZH8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc77Q9CZH8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms