Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cops7aQ9CZ04 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms