Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sgo1Q9CXH7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sgo1Q9CXH7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sgo1Q9CXH7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sgo1Q9CXH7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Sgo1Q9CXH7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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