Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmed5Q9CXE7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms