Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxxc1Q9CWW7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms