Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prkrip1Q9CWV6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms