Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pfdn1Q9CWM4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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