Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NubplQ9CWD8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NubplQ9CWD8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms