Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sycp2Q9CUU3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sycp2Q9CUU3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms