Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pard3bQ9CSB4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard3bQ9CSB4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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