Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Chchd5Q9CQP3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Chchd5Q9CQP3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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