Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms