Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rab5aQ9CQD1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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