Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ubl4bQ9CQ84 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubl4bQ9CQ84 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms