Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkp2Q9CQ73 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp2Q9CQ73 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms