Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpa3Q9CQ71 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpa3Q9CQ71 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms