Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
StambpQ9CQ26 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
StambpQ9CQ26 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms