Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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