Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Lrrc18Q9CQ07 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Lrrc18Q9CQ07 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms