Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl17Q9CPR4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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