Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2ird2Q99NI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms