Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NsmfQ99NF2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NsmfQ99NF2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms