Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Brms1Q99N20 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms