Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mccc1Q99MR8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.3 ms