Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp1b4Q99ME6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp1b4Q99ME6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms