Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tm2d1Q99MB3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tm2d1Q99MB3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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