Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdk5rap3Q99LM2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms