Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rcbtb2Q99LJ7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rcbtb2Q99LJ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms