Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms