Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pagr1aQ99L02 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms