Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TriobpQ99KW3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TriobpQ99KW3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms