Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab28Q99KL7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab28Q99KL7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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