Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hps4Q99KG7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms