Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Krcc1Q99JT5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krcc1Q99JT5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms