Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk9Q99J95 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms