Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddb2Q99J79 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddb2Q99J79 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ddb2Q99J79 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddb2Q99J79 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ddb2Q99J79 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ddb2Q99J79 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ddb2Q99J79 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ddb2Q99J79 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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