Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apobec3Q99J72 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Apobec3Q99J72 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms